Begoñazpi Ikastolak metodologia berritzaileak jarri ditu abian, ikasleen gaitasun logiko-matematikoa modu integralean garatzeko, eta horrela prestatzeko pentsatzeko, kritiko izateko, arazoak konpontzeko eta bizitza errealari aurre egiteko.
Bizikasi ekimenak lagundu nahi du ikastetxeak elkarbizitza positiborako espazio seguruak bilakatzea, hau da, inolako jazarpen-egoerarik onartuko ez dutenak. Izan ere, hori lortzea ezinbestekoa da hezkuntza sistemaren xede nagusia betetzeko: ikasle guztien garapen pertsonalean lagundu eta konpetentziak eta tresnak ematea herritar aktibo eta arduratsu gisa parte har dezaten gizartean.
